{"id":85455,"date":"2026-10-13T07:00:00","date_gmt":"2026-10-13T06:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/museoscienze.vda.it\/?p=85455"},"modified":"2026-10-12T14:59:32","modified_gmt":"2026-10-12T13:59:32","slug":"le-laboratoire-de-biotechnologies-du-musee","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/museoscienze.vda.it\/fr\/le-laboratoire-de-biotechnologies-du-musee\/","title":{"rendered":"Le laboratoire de biotechnologies du Mus\u00e9e"},"content":{"rendered":"\n

Comment lire le DNA d’un loup \u00e0 partir d’un poil trouv\u00e9 sur le terrain : le s\u00e9quenceur \u00e0 capillaires, la technique du DNA barcoding et la structure en trois zones physiquement s\u00e9par\u00e9es du laboratoire de biologie mol\u00e9culaire du Mus\u00e9e Efisio Noussan<\/em><\/p>\n\n\n\n

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Le Mus\u00e9e r\u00e9gional des Sciences naturelles Efisio Noussan n’est pas seulement le site d’exposition du ch\u00e2teau de Saint-Pierre, mais aussi le si\u00e8ge op\u00e9rationnel de La Salle qui comprend, entre autres, un laboratoire de biologie mol\u00e9culaire accomplissant un travail \u00e0 bien des \u00e9gards invisible mais scientifiquement d\u00e9terminant : lire le DNA des esp\u00e8ces animales, v\u00e9g\u00e9tales et fongiques pr\u00e9sentes sur le territoire valdotain, les identifier avec pr\u00e9cision et contribuer \u00e0 la connaissance de la biodiversit\u00e9 alpine.<\/p>\n\n\n\n

Le laboratoire de biotechnologies du Mus\u00e9e, r\u00e9alis\u00e9 \u00e0 partir de 2013 avec la contribution de la R\u00e9gion autonome Vall\u00e9e d’Aoste et du projet financ\u00e9 par les fonds FEDER \u00ab Unit\u00e9 de Recherche VDNA Barcoding \u00bb, est sp\u00e9cialis\u00e9 dans le s\u00e9quen\u00e7age du DNA de type Sanger et dans la Fragment Analysis<\/em> (analyse de fragments) : deux techniques bas\u00e9es sur l’utilisation d’un s\u00e9quenceur \u00e0 capillaires qui permettent respectivement de lire la s\u00e9quence des bases azot\u00e9es et d’estimer avec pr\u00e9cision la taille d’un fragment de DNA d\u00e9termin\u00e9.<\/p>\n\n\n\n

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Le s\u00e9quen\u00e7age Sanger : comment \u00e7a fonctionne<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

La m\u00e9thode Sanger tire son nom du biochimiste britannique Frederick Sanger, qui l’a d\u00e9velopp\u00e9e dans les ann\u00e9es 1970 et pour laquelle il a re\u00e7u son second prix Nobel de chimie en 1980. Dans sa version moderne et automatis\u00e9e, utilis\u00e9e dans le laboratoire du Mus\u00e9e, le processus se divise en plusieurs phases distinctes.<\/p>\n\n\n\n

Le DNA extrait de l’\u00e9chantillon biologique est d’abord amplifi\u00e9 par PCR (Polymerase Chain Reaction<\/em>), une technique qui multiplie ses copies des millions de fois, m\u00eame \u00e0 partir de quantit\u00e9s infinit\u00e9simales de mat\u00e9riel. Les fragments amplifi\u00e9s sont ensuite soumis \u00e0 la r\u00e9action de s\u00e9quen\u00e7age, au cours de laquelle des mol\u00e9cules appel\u00e9es did\u00e9soxynulcl\u00e9otides, marqu\u00e9es chacune par un colorant fluorescent diff\u00e9rent selon la base azot\u00e9e correspondante, interrompent la synth\u00e8se du DNA en produisant des fragments de longueur variable.<\/p>\n\n\n\n

Ces fragments sont ensuite s\u00e9par\u00e9s, sous l’effet d’un champ \u00e9lectrique, \u00e0 l’int\u00e9rieur de capillaires tr\u00e8s fins remplis de polym\u00e8re au moyen d’une \u00e9lectrophor\u00e8se capillaire : les fragments les plus courts migrent plus rapidement que les plus longs. Au fur et \u00e0 mesure qu’ils passent devant un d\u00e9tecteur laser, les colorants fluorescents \u00e9mettent des signaux que le logiciel traduit en un \u00e9lectrophor\u00e9gramme, une s\u00e9quence de pics color\u00e9s qui correspond \u00e0 la s\u00e9quence de bases du DNA analys\u00e9.<\/p>\n\n\n\n

DNA barcoding : identifier une esp\u00e8ce \u00e0 partir de son DNA<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Le DNA barcoding<\/em> (code-barres DNA) exploite la technique de s\u00e9quen\u00e7age pour identifier des esp\u00e8ces biologiques \u00e0 partir de traces. L’id\u00e9e, propos\u00e9e en 2003 par le biologiste canadien Paul Hebert, repose sur un principe simple : tout comme un code-barres identifie un produit dans les rayons d’un supermarch\u00e9, une courte s\u00e9quence standardis\u00e9e de DNA, correspondant \u00e0 une portion de g\u00e9nome diff\u00e9rente d’une esp\u00e8ce \u00e0 l’autre mais identique entre les individus d’une m\u00eame esp\u00e8ce, permet d’identifier un organisme m\u00eame lorsqu’il est impossible de le faire par observation visuelle.<\/p>\n\n\n\n

Pour les animaux, le \u00ab barcode \u00bb le plus utilis\u00e9 est une portion du g\u00e8ne mitochondrial COI (Cytochrome c Oxidase I<\/em>). Pour les plantes, on utilise g\u00e9n\u00e9ralement les r\u00e9gions rbcL<\/em> et matK<\/em> du chloroplaste. Pour les champignons, la r\u00e9gion ITS de l’RNA ribosomique.<\/p>\n\n\n\n

Appliqu\u00e9 \u00e0 la faune de la Vall\u00e9e d’Aoste, le DNA barcoding<\/em> permet de surveiller une esp\u00e8ce animale de mani\u00e8re non invasive, sans capturer l’animal, sans perturber la population et sans m\u00eame le voir. Il suffit en effet d’un poil trouv\u00e9 sur un grillage, d’une plume ramass\u00e9e sur un sentier, d’une crotte ou d’un fragment de tissu pour pouvoir l’identifier.<\/p>\n\n\n\n

La structure du laboratoire : trois zones physiquement s\u00e9par\u00e9es<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

La qualit\u00e9 des r\u00e9sultats produits par le laboratoire de biotechnologies d\u00e9pend de mani\u00e8re d\u00e9terminante de son organisation. Le laboratoire est structur\u00e9 en trois zones physiquement s\u00e9par\u00e9es, d\u00e9finies en fonction du risque de contamination par le DNA.<\/p>\n\n\n\n

La NO DNA AREA<\/strong> est la zone la plus contr\u00f4l\u00e9e, dans laquelle sont pr\u00e9par\u00e9es les solutions et les m\u00e9langes de r\u00e9action pour la PCR et le Cycle Sequencing<\/em>. Dans cette zone se trouvent la hotte PCR avec lampes UV pour d\u00e9contaminer la surface de travail, les balances technique et analytique, l’autoclave et l’\u00e9tuve thermostatique. Aucun extrait de DNA ne doit p\u00e9n\u00e9trer dans cette zone car de minimes traces pourraient entra\u00eener des contaminations lors des phases d’amplification ult\u00e9rieures.<\/p>\n\n\n\n

La LOW DNA AREA<\/strong> est la zone de r\u00e9ception, de pr\u00e9paration des \u00e9chantillons et d’extraction du DNA. Ici, les \u00e9chantillons biologiques sont enregistr\u00e9s, photographi\u00e9s et, si n\u00e9cessaire, observ\u00e9s au microscope : le laboratoire dispose d’un microscope optique \u00e0 transmission et d’un st\u00e9r\u00e9omicroscope, tous deux reli\u00e9s \u00e0 une cam\u00e9ra num\u00e9rique. Le DNA est extrait \u00e0 l’aide de proc\u00e9dures impliquant l’utilisation de centrifugeuses, d’agitateurs et de thermomixeurs. Une hotte biologique \u00e0 flux laminaire st\u00e9rile est \u00e9galement pr\u00e9sente pour l’extraction du DNA \u00e0 partir d’\u00e9chantillons n\u00e9cessitant des conditions de travail particuli\u00e8rement contr\u00f4l\u00e9es, comme le DNA environnemental.<\/p>\n\n\n\n

La HIGH DNA AREA<\/strong> est la zone dans laquelle le DNA amplifi\u00e9 est analys\u00e9. C’est ici que se trouvent le thermocycleur pour la PCR, le poste d’\u00e9lectrophor\u00e8se du DNA et le s\u00e9quenceur \u00e0 capillaires pour le s\u00e9quen\u00e7age Sanger et la Fragment Analysis<\/em>. Une hotte chimique est \u00e9galement pr\u00e9sente pour la manipulation de r\u00e9actifs toxiques ou dangereux.<\/p>\n\n\n\n

La s\u00e9paration physique entre les trois zones n’est pas une mesure de pr\u00e9caution accessoire. La PCR est une technique tellement sensible qu’elle amplifie des traces infinit\u00e9simales de DNA, y compris le DNA des op\u00e9rateurs du laboratoire eux-m\u00eames, si les pr\u00e9cautions n\u00e9cessaires ne sont pas prises. Maintenir les phases de pr\u00e9paration rigoureusement s\u00e9par\u00e9es des phases d’amplification est la condition essentielle qui permet de produire des r\u00e9sultats scientifiquement fiables.<\/p>\n\n\n\n

Les applications : de la faune \u00e0 la tra\u00e7abilit\u00e9 agroalimentaire<\/strong><\/h3>\n\n\n\n

Les activit\u00e9s du laboratoire de biotechnologies du Mus\u00e9e vont de la recherche naturaliste \u00e0 la valorisation des productions locales. Sur le plan naturaliste, le laboratoire m\u00e8ne des projets de suivi g\u00e9n\u00e9tique non invasif des esp\u00e8ces animales pr\u00e9sentes sur le territoire valdotain, notamment le loup, et a contribu\u00e9 \u00e0 l’\u00e9tude de la biodiversit\u00e9 de la faune et de la v\u00e9g\u00e9tation sauvage alpine gr\u00e2ce \u00e0 des techniques de DNA fingerprinting<\/em>. Sur le plan agroalimentaire, il a d\u00e9velopp\u00e9 des protocoles de caract\u00e9risation g\u00e9n\u00e9tique des mati\u00e8res premi\u00e8res valdotaines et de tra\u00e7abilit\u00e9 des produits tout au long de la cha\u00eene de production.<\/p>\n\n\n\n

Le laboratoire est en outre ouvert \u00e0 l’accueil d’\u00e9tudiants universitaires pour des stages et des th\u00e8ses exp\u00e9rimentales, sous r\u00e9serve de la signature d’une convention entre l’universit\u00e9 et l’organisme d’accueil, et propose des parcours p\u00e9dagogiques pour les \u00e9tablissements d’enseignement secondaire sur des th\u00e9matiques li\u00e9es aux biotechnologies.<\/p>\n\n\n\n

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